En 2004 et 2005, la Communauté d'Agglomération a réalisé un inventaire des espaces naturels remarquables de son territoire. Il s'agissait, parallèlement à l'élaboration de la Charte de l'Environnement, d'appréhender de façon précise l'état de la biodiversité sur le territoire communautaire, pour mieux en tenir compte dans les documents d'urbanisme et les projets d'aménagement mais aussi de favoriser une gestion active et la valorisation de ces milieux souvent méconnus.

Cet inventaire a été réalisé par le Conservatoire Régional des Espaces Naturels (CREN) et la Ligue pour la Protection des Oiseaux (LPO).

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Cet inventaire est suivi, entre 2006 et 2008, d'un programme de sensibilisation des propriétaires et gestionnaires des milieux naturels sur l'intérêt de conserver et de valoriser les milieux naturels. Plusieurs actions ont déjà été engagées :

Mise en place d'un Plan de Développement de Massif forestier (PDM ) en partenariat avec le CRPF

Dans le cadre du PDM , les propriétaires privés de bois ont accès à un diagnostic de leurs parcelles. Ce diagnostic préconise les actions à mettre en place. En fonction de la motivation des propriétaires, des actions collectives sont proposées pour mieux gérer les bois dans une optique de gestion durable. Le plan de développement de massif a démarré en avril 2007 et s'étalera sur 3 ans.

Participation au plan de gestion de la Forêt de Bastard

La Forêt de Bastard de Pau est classée "Espace Naturel Sensible du Département ". La Communauté d'Agglomération s'est associée à la Ville de Pau, à l'ONF et au Conseil Général des Pyrénées-Atlantiques dans le cadre d'un plan de gestion de ce site remarquable. Elle intervient plus particulièrement sur le financement d'actions à caractère naturaliste : mise en place d'ilôts de vieux bois, inventaires faunistiques et floristiques ... 

Facilitation du projet de préservation et de valorisation du site fossilifère de Gan

Fin 2006, la commune de Gan a confié au CREN Aquitaine la gestion et la valorisation de son site fossilifère qui devrait être classé "Espace Naturel Sensible du Département " en 2007. L'objectif principal est de préserver le site des dégradations par pillage et de proposer des actions de mise en valeur de ce patrimoine exceptionnel. La Communauté d'Agglomération participe au financement du plan de gestion et assiste la commune dans ses relations avec les autres partenaires du projet.

Organisation d'une journée de sensibilisation des propriétaires de pelouses sèches

Le 21 avril 2007, élus et propriétaires ont été invités à découvrir les richesses des pelouses sèches à orchidées des coteaux de Gan et de Jurançon. Une quinzaine de personnes a participé à cette journée et plusieurs pistes d'actions ont été suggérées.

En lien avec ces démarches, la communauté d'Agglomération a réalisé un inventaire des corridors écologiques indispensables à la circulation de la faune, à la dissémination de la flore et donc au maintien de la biodiversité. Cet inventaire permet notamment de mieux cibler les haies, chemins, bois... à conserver lors de l'élaboration ou de la révision des documents d'urbanisme.